from AASJ
この記事は、バーコード技術やマイクロフルイディックス技術の進歩により、遺伝子発現やゲノム、エピゲノムの解析が可能になったことを述べています。しかし、これまでの技術では、新鮮な組織や急速凍結された組織からの細胞や核にしか適用できませんでした。そのため、大学や研究機関で保存されている古い固定標本は利用できませんでした。
この記事では、テキサス・MDアンダーソンがん研究所の研究によって、フォルマリン固定後パラフィン包埋された組織から単一核を取り出し、ゲノム解析が可能になったことが紹介されています。この研究では、フォルマリン処理された核からゲノム配列を解析する方法が確立されました。具体的な手順としては、パラフィン包埋ブロックを処理して核を分離し、DNAを染色し、セルソーターで品質をチェックし、マイクロウェルに核を入れます。そして、核を溶解してDNAにタグ付けし、バーコードを付加し、PCR増幅して配列決定します。
この方法によって、古い固定標本からでも十分なゲノム情報が得られることが確認されました。この方法を使って、再発した乳ガンの進化を調べた結果、乳ガン細胞は多様化しており、さまざまな遺伝子増幅が発生していることがわかりました。また、再発ガンと原発ガンでは進化の様式に違いがあり、再発ガンは外科手術よりも前の治療が必要であることが示されました。
この研究の成果は、古い固定標本からも解析が可能になったことであり、他の疾患にも応用できる可能性があります。また、乳ガンの治療においても、外科手術以外の治療が必要であることを再確認する結果となりました。
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