from AASJ
ADシリーズの2番目の論文は、single cellレベルのエピゲノム解析に関するものです。この研究では、single cell RNAシーケンシングとATAC-seqを使用して、遺伝子発現レベルと転写を調節する領域のクロマチン状態を調べました。これにより、遺伝子発現と転写調節領域のクロマチン状態を統合し、遺伝子発現の活性を推測することができます。この研究により、ADリスクと関連するゲノム領域の機能を特定する可能性があります。
ADリスク遺伝子は、蛋白質をコードする遺伝子変異が関与しており、アミロイド遺伝子や酵素の変異がADリスク遺伝子として特定されています。また、ADリスクと関連する遺伝子の多くは、蛋白質をコードしている領域ではなく、遺伝子調節領域に存在しています。この研究では、ADリスク領域の機能を調べるために、遺伝子調節領域と遺伝子発現が統合された方法を使用しています。研究では、AD関連調節領域とADリスク多型領域の機能を比較し、ADリスク領域が転写調節を介してADに関与することを示しています。また、最も明確な相関を示した領域の多くは、ミクログリアで働いていることがわかりました。
最後に、ADの進行によりクロマチン情報と遺伝子発現情報の関係が失われ、クロマチン状態の正確な維持ができなくなることが明らかになりました。この背景には、核内の3次元構造の崩壊が関与している可能性があります。
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