from AASJ
この文章は、生成AIモデルの一つであるAlphaFoldによって、過去に物理化学に基づく構造予測が行われていた蛋白質の構造をほぼ完全に予測できるようになったことについて述べています。AlphaFoldデータベースでは現在、2億種類の蛋白質構造が見られるようになっており、これまで見たこともない蛋白質の構造が提供されています。
また、9月13日にはAlphaFoldから新しい世界が見えるという2つの論文が発表されました。この中で、韓国ソウル国立大学とスイスチューリッヒ工科大学の研究者が、2億種類の蛋白質構造を解析するアプリケーションを開発し、新たな構造が見える世界を示しました。
具体的な研究結果としては、AlphaFoldは既に解析された36万種類の構造と92%の一致率があり、信頼性の高い構造データベースとして利用されています。しかし、2億種類を超える新たに予測された構造の相同性やドメイン機能を解析するには非常に時間がかかるため、モンスターCPUを使用しても10年以上かかると言われています。
そこで、この研究では、AlphaFoldデータベースから相同クラスターを特定し、構造から相同性や機能を解析するアプリケーション「Foldseek」を開発しました。Foldseekにより、2億の蛋白質が200万のクラスターに分類され、そのうち31%は構造的なアノテーションが行われていないことが分かりました。
さらに、この研究ではいくつかの新たな発見もあります。例えば、アノテーションが行われていない蛋白質の機能が予測できるようになったことや、古い構造や共通の構造が見つかったこと、自然免疫に関わる分子やDNAセンサーに関する発見などがあります。
最後に、この研究は蛋白質の機能や進化研究にとって新たな展望を提供しており、興味深い研究結果が得られたと述べられています。
*Disclamer:本キュレーションはAASJからピックおよび自動生成されました。正確な内容や詳細を知りたい方はリンク先の元コンテンツをご覧ください。
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