AlphaFoldによる蛋白質構造予測の進化とFoldseekアプリケーションの開発（AASJ）

from AASJ

生成AIモデルの一つであるAlphaFoldは、物理化学に基づく構造予測を大きく進化させ、２億種類の蛋白質構造を解析することができるようになりました。AlphaFoldのデータベースでは、実際の構造を見たことのない蛋白質の構造が提供されています。

韓国ソウル国立大学とスイスチューリッヒ工科大学の研究者は、AlphaFoldデータベースから５千万の相同クラスターを特定し、新たな構造と機能を解析するためのアプリケーション「Foldseek」を開発しました。Foldseekにより、２億の蛋白質は２００万のクラスターに分類され、そのうち３１％は構造的なアノテーションがされていませんでした。この研究により、新たな蛋白質の機能や進化について多くの発見がありました。

論文を読むことで、蛋白質の機能や進化研究において新たな展望が得られるでしょう。

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