from AASJ
この記事は、生成AIモデルの一つであるAlphaFoldが生命科学への応用において重要な役割を果たしていることを紹介しています。AlphaFoldは、蛋白質の構造予測において従来の物理化学に基づく手法を超える成果を上げており、現在2億種類の蛋白質構造がAlphaFoldデータベースで利用できるようになっています。
このデータを解析するための研究が、韓国ソウル国立大学とスイスチューリッヒ工科大学から発表され、新たな蛋白質の構造や機能が明らかにされました。この研究により、多くの蛋白質の機能が予測可能となり、進化の研究においても新たな発見がされました。また、AlphaFoldデータベースは既に信頼性が高く、公開データとしても利用されています。
ただし、2億を超える蛋白質の相同性や機能を解析するためには、高性能な計算機が必要であり、アノテーションが行われていない蛋白質も多く存在しています。この研究では、AlphaFoldデータベースから5日間で5000万の相同クラスターを特定し、構造から相同性や機能を解析するためのアプリケーション「Foldseek」を開発しました。Foldseekにより、2億の蛋白質が200万のクラスターに分類され、アノテーションが行われていない蛋白質も存在することがわかりました。これにより、蛋白質の機能や進化に関する新たな知見が得られる可能性があります。
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