AlphaFoldによる蛋白質構造の予測が進化し、2億種類の蛋白質を解析可能に(AASJ)

from AASJ

生成AIモデルの一つであるAlphaFoldは、物理化学に基づく蛋白質構造の予測を大きく進化させ、2億種類の蛋白質構造を解析することが可能になりました。AlphaFoldデータベースでは、実際の構造が分かっていない蛋白質の構造が提供されています。

9月13日には、韓国ソウル国立大学とスイスチューリッヒ工科大学から、AlphaFoldを用いた2つの論文が発表されました。これらの論文では、AlphaFoldデータベースから新たな蛋白質の構造を見つけ出すためのアプリケーションが開発され、多くの未知の構造が明らかにされました。また、AlphaFoldは既に解析された36万種類の構造と92%の一致率を持ち、信頼性が高く、公開データの利用も進んでいます。

しかし、2億以上の新たな構造の相同性や機能を解析するには、モンスターCPUを使用しても10年以上かかるため、まだほとんどの蛋白質がアノテーションされていない状態です。この研究では、AlphaFoldデータベースから5日間で5,000万の相同クラスターを特定するアプリケーションが開発され、2億の蛋白質が200万のクラスターに分類されました。そのうち31%は構造的なアノテーションが行われていないという結果が得られました。

さらに、この研究では、蛋白質の機能や進化に関する新たな知見も示されています。


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