スイスバーゼル大学の研究により、新たなデータ解析方法で蛋白質の相同性を解明(AASJ)

from AASJ

この記事は、スイスバーゼル大学からの論文について説明しています。この研究では、蛋白質の構造を比較することで、相同性がわからなかった蛋白質についての新しいデータ解析方法が開発されました。また、アノテーションを進めるための様々な戦略が試され、新しい蛋白質ファミリーや構造が解明されました。研究では、3億5千万の蛋白質をクラスター分けし、関係を示すネットワークを作成しました。さらに、アノテーションや構造の類似性などを加えたデータベースも作成されました。

研究では、アノテーションができなかった蛋白質クラスターを「ダークマター」と呼び、それに対してアノテーションを試みました。この結果、ダークマターとされるクラスターにも一部のアノテーションが可能であることがわかりました。さらに、アノテーションができなかった蛋白質も詳しく解析すると機能が明らかになる場合がありました。研究では、ダークマタークラスターをAIに読み込ませる実験も行われ、多様な答えが得られることが確認されました。

最後に、Protein databankに登録されていない構造を特定するモデルも作成され、新しい構造が発見されました。この研究は、新たな蛋白質の構造や機能を解明するための戦略を示しており、今後の研究の重要な研究領域となることが期待されています。


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