from AASJ
この記事は、ChatGPTが公開される前から、生命科学への導入が進められていた生成AIモデルの一つであるTransformer/attentionを使った研究について説明しています。特に、Googleの研究室から発表されたAlphaFoldというモデルが、物理化学に基づく構造予測の方法を大きく進化させたことが述べられています。
AlphaFoldによって、2億種類の蛋白質構造がデータベースで利用できるようになりました。このデータを利用して新たな世界を解析する2つの論文が発表され、その内容について紹介されています。また、AlphaFoldは既に解析された構造と高い一致率を持っており、信頼性が高いとされていますが、2億を超える構造を解析するためには非常に長い時間がかかるという課題もあります。
この研究では、AlphaFoldデータベースから相同クラスターを特定するアプリケーション「Foldseek」を開発し、新たな世界を示しています。さらに、論文ではいくつかの新しい発見の例も紹介されています。最後に、読者には論文を読んで新しい景色を楽しんでほしいとのメッセージが述べられています。
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