from AASJ
ChatGPTの公開以前から、生命科学におけるTransformer/attentionと呼ばれる生成AIモデルの導入が進められていました。その中でも最も注目すべき成果がGoogleの研究室から発表されたAlphaFoldです。AlphaFoldは従来の物理化学に基づく構造予測をほぼ過去のものにし、現在では2億種類の蛋白質構造がAlphaFoldデータベースで利用できるようになりました。つまり、実際の構造を見たこともない蛋白質の構造が提供されています。
9月13日には、AlphaFoldから見える新しい世界を解析する2つの論文がNatureに発表されました。今日はそのうちの1つである韓国ソウル国立大学とスイスチューリッヒ工科大学からの論文を紹介します。この研究では、2億種類の蛋白質構造を解析するアプリケーションが開発され、新たな構造から見える世界が示されました。研究のハイライトは、Foldseekというアプリケーションによって新たに見えてきたいくつかの例が示されていることです。
Foldseekにより、2億の蛋白質が200万のクラスターに分類され、そのうち31％は構造的なアノテーションが行われていませんでした。ただし、全体の4％程度の蛋白質がアノテーションが行われていないだけで、これまでの構造研究で多くのことが明らかになっていることも分かりました。また、相同性の基準を緩めれば、より新しい世界が見える可能性もあります。
この研究ではさまざまな新しい発見がありますが、それらをすべて紹介することはできません。是非論文を読んで、蛋白質の機能や進化研究において全く新しい視点が得られることを体感してください。
*Disclamer:本キュレーションはAASJからピックおよび自動生成されました。正確な内容や詳細を知りたい方はリンク先の元コンテンツをご覧ください。
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