from AASJ
この記事は、生成AIモデルの一つであるTransformer/attentionを使った生命科学への導入について述べています。特にGoogleの研究室から発表されたAlphaFoldというモデルは、物理化学に基づく構造予測を大きく進歩させました。AlphaFoldデータベースでは、2億種類の蛋白質構造が見られるようになりました。
この記事では、AlphaFoldから見える新たな世界についての2つの論文が紹介されています。韓国ソウル国立大学とスイスチューリッヒ工科大学の研究チームが開発したアプリケーションで、AlphaFoldデータベースの構造解析を行い、新たな構造や機能を示しています。Foldseekと呼ばれるこのアプリケーションにより、2億の蛋白質が200万のクラスターに分類され、31％の蛋白質は構造的なアノテーションが行われていないことがわかりました。また、この研究により、蛋白質の相同性や機能の予測が可能になりました。記事では、いくつかの具体的な例も挙げられています。
これらの研究により、蛋白質の機能や進化研究において新たな視点が得られることが期待されています。
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