from AASJ
空間トランスクリプトーム法は、組織標本上でRNAやタンパク質の発現を調べたり、トランスクリプトームを調べたりする方法であり、高額でも利用可能なテクノロジーとして注目されています。シカゴ大学の研究では、抗体を用いた染色とVisiumトランスクリプトームを組み合わせることで、分子間や細胞間の相互作用が起こっている場所でのトランスクリプトームの変化を解析する方法が開発されました。
この研究では、胚中心というリンパ組織内の構造を対象にしており、抗原刺激により免疫反応が進む組織での遺伝子発現変化を調べることが目的です。研究では、Visiumと呼ばれる空間トランスクリプトーム法を拡張し、32種類の抗体を用いて分子間相互作用を特定する新しい方法を開発しました。
この方法により、接着分子同士の結合などの情報を空間的にマッピングすることが可能になりました。今後、この手法は発生学や免疫学、腫瘍学など様々な分野で活用されることが期待されています。
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