from AASJ
DNAに結合している転写因子などを免疫沈降してDNA結合モチーフを調べるChip-seq法は、転写研究において重要な技術となっています。しかし、これをsingle cellレベルに適用する方法は存在しませんでした。
コーネル大学の研究チームは、転写因子が結合している部位のシトシンをデアミナーゼでウラシルに変換することで、より効率の高い標識方法を開発しました。この方法をAtac-seqと組み合わせることで、single cellレベルで特定の転写因子の結合している配列をゲノムワイドに特定することが可能となりました。
この研究では、様々な細胞での解析を行い、特定の分子が集まる部位を特定することや、ゲノムの構造に変化が及ぼす影響を明らかにしました。今後は、この技術をさらに高め、クロマチンの構造にかかわらずゲノムに結合する分子の動態を追跡することが期待されています。
Chip-seqから考えると、この技術の進歩は時間がかかりましたが、より精密な転写研究が可能になるでしょう。
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